Ti år efter stjerneskibet Voyagers tilbagekomst fra Delta-kvadranten er Føderationen i krise. Føderationens hovedleverandører af dilithiumkrystaller (den primære katalysator for brændstoffet, der bruges i hurtigere end lyset-rejser) er ved at forsvinde. Rum og tid har foldet sig omkring adskillige planeter og isoleret dem fra kontakt udefra. Fænomenet er unaturligt – nogen eller noget forårsager det. Behovet for at stoppe dette nødvendiggør drastiske foranstaltninger, hvoraf nogle ligger uden for Føderationens normale jurisdiktion.